Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab33aP97950 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms