Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Smn1P97801 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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