Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx2P97474 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms