Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmklr1P97468 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms