Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nbr1P97432 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms