Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3aP97351 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms