Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mesp1P97309 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms