Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hist1h3bP84228 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hist1h3bP84228 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms