Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgcaP82350 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcaP82350 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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