Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53bp1P70399 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms