Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp3P70281 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp3P70281 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms