Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf6P70279 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms