Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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