Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crabp1P62965 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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