Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vsnl1P62761 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms