Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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