Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp1cbP62141 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1cbP62141 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1cbP62141 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms