Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2iP60898 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.5 ms