Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snap25P60879 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snap25P60879 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms