Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ActbP60710 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ActbP60710 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ActbP60710 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ActbP60710 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ActbP60710 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms