Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup43P59235 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup43P59235 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup43P59235 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms