Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P58686 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P58686 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P58686 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P58686 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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