Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp1P58466 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp1P58466 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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