Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dpf3P58269 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dpf3P58269 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms