Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckbrP56481 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckbrP56481 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms