Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab8aP55258 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms