Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PltpP55065 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PltpP55065 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PltpP55065 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PltpP55065 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PltpP55065 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PltpP55065 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms