Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a1P55014 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a1P55014 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms