Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23bP54728 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad23bP54728 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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