Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Map3k1P53349 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms