Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna1P52793 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms