Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp1P52624 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms