Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2e3P52483 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms