Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CntfP51642 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CntfP51642 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CntfP51642 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CntfP51642 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms