Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa8P50706 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa8P50706 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa8P50706 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms