Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3P48787 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms