Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LmnaP48678 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LmnaP48678 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LmnaP48678 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms