Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms