Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-2P42580 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms