Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tac1P41539 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tac1P41539 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms