Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Etv1P41164 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms