Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox7P40646 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms