Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TfamP40630 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TfamP40630 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TfamP40630 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TfamP40630 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms