Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik2P39087 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms