Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprkP35822 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprkP35822 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprkP35822 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms