Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc5P35689 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc5P35689 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms