Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp1P29452 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp1P29452 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms