Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb1P28230 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms