Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms