Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vav1P27870 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms